Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snai1Q02085 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Snai1Q02085 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Snai1Q02085 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Snai1Q02085 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Snai1Q02085 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Snai1Q02085 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Snai1Q02085 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Snai1Q02085 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Snai1Q02085 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Snai1Q02085 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Snai1Q02085 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Snai1Q02085 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snai1Q02085 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snai1Q02085 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snai1Q02085 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snai1Q02085 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snai1Q02085 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snai1Q02085 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snai1Q02085 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snai1Q02085 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Snai1Q02085 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snai1Q02085 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snai1Q02085 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Snai1Q02085 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snai1Q02085 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snai1Q02085 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snai1Q02085 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snai1Q02085 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snai1Q02085 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snai1Q02085 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snai1Q02085 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snai1Q02085 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snai1Q02085 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Snai1Q02085 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Snai1Q02085 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snai1Q02085 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snai1Q02085 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snai1Q02085 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snai1Q02085 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snai1Q02085 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snai1Q02085 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snai1Q02085 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snai1Q02085 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Snai1Q02085 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snai1Q02085 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snai1Q02085 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snai1Q02085 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snai1Q02085 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snai1Q02085 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snai1Q02085 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snai1Q02085 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snai1Q02085 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snai1Q02085 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snai1Q02085 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Snai1Q02085 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snai1Q02085 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snai1Q02085 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snai1Q02085 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snai1Q02085 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snai1Q02085 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snai1Q02085 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snai1Q02085 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snai1Q02085 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snai1Q02085 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snai1Q02085 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snai1Q02085 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snai1Q02085 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snai1Q02085 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snai1Q02085 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snai1Q02085 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snai1Q02085 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Snai1Q02085 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snai1Q02085 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snai1Q02085 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snai1Q02085 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snai1Q02085 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snai1Q02085 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snai1Q02085 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snai1Q02085 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snai1Q02085 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Snai1Q02085 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snai1Q02085 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snai1Q02085 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snai1Q02085 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snai1Q02085 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snai1Q02085 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snai1Q02085 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snai1Q02085 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snai1Q02085 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snai1Q02085 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snai1Q02085 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snai1Q02085 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Snai1Q02085 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snai1Q02085 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snai1Q02085 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snai1Q02085 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snai1Q02085 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snai1Q02085 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snai1Q02085 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms