Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grin2cQ01098 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grin2cQ01098 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Grin2cQ01098 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grin2cQ01098 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grin2cQ01098 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grin2cQ01098 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grin2cQ01098 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grin2cQ01098 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grin2cQ01098 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grin2cQ01098 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grin2cQ01098 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grin2cQ01098 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grin2cQ01098 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grin2cQ01098 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grin2cQ01098 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grin2cQ01098 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grin2cQ01098 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grin2cQ01098 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grin2cQ01098 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grin2cQ01098 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grin2cQ01098 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grin2cQ01098 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grin2cQ01098 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grin2cQ01098 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grin2cQ01098 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grin2cQ01098 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grin2cQ01098 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Grin2cQ01098 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grin2cQ01098 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grin2cQ01098 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grin2cQ01098 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grin2cQ01098 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Grin2cQ01098 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grin2cQ01098 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grin2cQ01098 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grin2cQ01098 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grin2cQ01098 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grin2cQ01098 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grin2cQ01098 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grin2cQ01098 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Grin2cQ01098 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grin2cQ01098 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grin2cQ01098 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grin2cQ01098 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grin2cQ01098 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grin2cQ01098 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grin2cQ01098 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Grin2cQ01098 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grin2cQ01098 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grin2cQ01098 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grin2cQ01098 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grin2cQ01098 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grin2cQ01098 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grin2cQ01098 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Grin2cQ01098 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Grin2cQ01098 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grin2cQ01098 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grin2cQ01098 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grin2cQ01098 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Grin2cQ01098 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Grin2cQ01098 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Grin2cQ01098 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Grin2cQ01098 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Grin2cQ01098 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grin2cQ01098 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grin2cQ01098 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grin2cQ01098 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grin2cQ01098 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grin2cQ01098 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grin2cQ01098 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grin2cQ01098 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grin2cQ01098 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grin2cQ01098 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grin2cQ01098 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grin2cQ01098 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grin2cQ01098 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grin2cQ01098 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grin2cQ01098 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grin2cQ01098 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grin2cQ01098 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grin2cQ01098 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grin2cQ01098 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Grin2cQ01098 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grin2cQ01098 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grin2cQ01098 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grin2cQ01098 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grin2cQ01098 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grin2cQ01098 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Grin2cQ01098 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grin2cQ01098 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grin2cQ01098 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grin2cQ01098 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grin2cQ01098 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grin2cQ01098 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grin2cQ01098 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grin2cQ01098 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grin2cQ01098 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grin2cQ01098 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grin2cQ01098 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms