Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Serpina1cQ00896 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Serpina1cQ00896 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Serpina1cQ00896 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Serpina1cQ00896 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Serpina1cQ00896 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Serpina1cQ00896 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Serpina1cQ00896 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Serpina1cQ00896 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Serpina1cQ00896 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Serpina1cQ00896 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Serpina1cQ00896 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Serpina1cQ00896 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Serpina1cQ00896 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Serpina1cQ00896 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Serpina1cQ00896 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Serpina1cQ00896 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Serpina1cQ00896 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Serpina1cQ00896 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Serpina1cQ00896 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Serpina1cQ00896 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Serpina1cQ00896 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Serpina1cQ00896 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Serpina1cQ00896 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Serpina1cQ00896 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Serpina1cQ00896 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Serpina1cQ00896 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Serpina1cQ00896 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Serpina1cQ00896 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Serpina1cQ00896 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Serpina1cQ00896 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Serpina1cQ00896 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Serpina1cQ00896 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Serpina1cQ00896 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Serpina1cQ00896 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Serpina1cQ00896 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Serpina1cQ00896 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Serpina1cQ00896 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Serpina1cQ00896 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Serpina1cQ00896 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Serpina1cQ00896 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Serpina1cQ00896 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Serpina1cQ00896 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Serpina1cQ00896 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Serpina1cQ00896 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Serpina1cQ00896 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Serpina1cQ00896 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Serpina1cQ00896 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Serpina1cQ00896 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Serpina1cQ00896 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Serpina1cQ00896 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Serpina1cQ00896 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Serpina1cQ00896 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Serpina1cQ00896 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Serpina1cQ00896 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Serpina1cQ00896 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Serpina1cQ00896 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Serpina1cQ00896 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Serpina1cQ00896 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Serpina1cQ00896 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Serpina1cQ00896 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Serpina1cQ00896 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Serpina1cQ00896 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Serpina1cQ00896 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Serpina1cQ00896 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Serpina1cQ00896 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Serpina1cQ00896 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Serpina1cQ00896 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Serpina1cQ00896 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Serpina1cQ00896 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Serpina1cQ00896 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Serpina1cQ00896 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Serpina1cQ00896 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Serpina1cQ00896 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Serpina1cQ00896 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Serpina1cQ00896 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Serpina1cQ00896 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Serpina1cQ00896 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Serpina1cQ00896 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Serpina1cQ00896 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Serpina1cQ00896 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Serpina1cQ00896 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Serpina1cQ00896 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Serpina1cQ00896 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Serpina1cQ00896 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Serpina1cQ00896 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Serpina1cQ00896 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Serpina1cQ00896 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Serpina1cQ00896 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Serpina1cQ00896 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Serpina1cQ00896 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Serpina1cQ00896 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Serpina1cQ00896 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Serpina1cQ00896 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Serpina1cQ00896 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Serpina1cQ00896 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Serpina1cQ00896 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Serpina1cQ00896 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Serpina1cQ00896 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Serpina1cQ00896 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms