Protein–RNA interactions for Protein: Q00417

Tcf7, Transcription factor 7, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf7Q00417 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tcf7Q00417 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tcf7Q00417 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tcf7Q00417 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tcf7Q00417 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tcf7Q00417 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tcf7Q00417 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tcf7Q00417 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tcf7Q00417 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tcf7Q00417 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tcf7Q00417 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tcf7Q00417 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tcf7Q00417 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tcf7Q00417 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tcf7Q00417 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tcf7Q00417 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Tcf7Q00417 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tcf7Q00417 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tcf7Q00417 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tcf7Q00417 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tcf7Q00417 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tcf7Q00417 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tcf7Q00417 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tcf7Q00417 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tcf7Q00417 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tcf7Q00417 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tcf7Q00417 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tcf7Q00417 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tcf7Q00417 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tcf7Q00417 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tcf7Q00417 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tcf7Q00417 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tcf7Q00417 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tcf7Q00417 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tcf7Q00417 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tcf7Q00417 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcf7Q00417 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcf7Q00417 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcf7Q00417 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcf7Q00417 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcf7Q00417 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcf7Q00417 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcf7Q00417 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcf7Q00417 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcf7Q00417 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcf7Q00417 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcf7Q00417 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcf7Q00417 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcf7Q00417 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcf7Q00417 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcf7Q00417 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcf7Q00417 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcf7Q00417 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcf7Q00417 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcf7Q00417 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcf7Q00417 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcf7Q00417 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcf7Q00417 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcf7Q00417 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcf7Q00417 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcf7Q00417 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcf7Q00417 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcf7Q00417 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcf7Q00417 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcf7Q00417 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcf7Q00417 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcf7Q00417 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcf7Q00417 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcf7Q00417 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcf7Q00417 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcf7Q00417 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcf7Q00417 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcf7Q00417 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcf7Q00417 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcf7Q00417 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcf7Q00417 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcf7Q00417 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcf7Q00417 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcf7Q00417 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcf7Q00417 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tcf7Q00417 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms