Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Shc1P98083 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Shc1P98083 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Shc1P98083 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Shc1P98083 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Shc1P98083 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Shc1P98083 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Shc1P98083 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Shc1P98083 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Shc1P98083 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Shc1P98083 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Shc1P98083 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Shc1P98083 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Shc1P98083 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Shc1P98083 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Shc1P98083 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Shc1P98083 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Shc1P98083 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Shc1P98083 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Shc1P98083 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Shc1P98083 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Shc1P98083 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Shc1P98083 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Shc1P98083 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Shc1P98083 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Shc1P98083 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Shc1P98083 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Shc1P98083 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Shc1P98083 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Shc1P98083 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Shc1P98083 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Shc1P98083 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Shc1P98083 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Shc1P98083 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Shc1P98083 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Shc1P98083 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Shc1P98083 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Shc1P98083 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Shc1P98083 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Shc1P98083 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Shc1P98083 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Shc1P98083 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Shc1P98083 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Shc1P98083 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Shc1P98083 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Shc1P98083 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Shc1P98083 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Shc1P98083 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Shc1P98083 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Shc1P98083 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Shc1P98083 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Shc1P98083 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Shc1P98083 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms