Protein–RNA interactions for Protein: P97477

Aurka, Aurora kinase A, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkaP97477 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AurkaP97477 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
AurkaP97477 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AurkaP97477 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AurkaP97477 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AurkaP97477 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AurkaP97477 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AurkaP97477 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AurkaP97477 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AurkaP97477 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AurkaP97477 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AurkaP97477 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AurkaP97477 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AurkaP97477 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AurkaP97477 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AurkaP97477 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AurkaP97477 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
AurkaP97477 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AurkaP97477 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AurkaP97477 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AurkaP97477 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AurkaP97477 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
AurkaP97477 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
AurkaP97477 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
AurkaP97477 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
AurkaP97477 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
AurkaP97477 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
AurkaP97477 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
AurkaP97477 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
AurkaP97477 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
AurkaP97477 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
AurkaP97477 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
AurkaP97477 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
AurkaP97477 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
AurkaP97477 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
AurkaP97477 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
AurkaP97477 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
AurkaP97477 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
AurkaP97477 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
AurkaP97477 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AurkaP97477 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AurkaP97477 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
AurkaP97477 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
AurkaP97477 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AurkaP97477 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AurkaP97477 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AurkaP97477 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
AurkaP97477 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AurkaP97477 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20■□□□□ 0.79
AurkaP97477 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
AurkaP97477 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AurkaP97477 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20■□□□□ 0.79
AurkaP97477 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AurkaP97477 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
AurkaP97477 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AurkaP97477 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AurkaP97477 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AurkaP97477 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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AurkaP97477 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
AurkaP97477 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
AurkaP97477 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
AurkaP97477 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
AurkaP97477 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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AurkaP97477 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AurkaP97477 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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AurkaP97477 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AurkaP97477 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AurkaP97477 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AurkaP97477 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AurkaP97477 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AurkaP97477 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AurkaP97477 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AurkaP97477 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
AurkaP97477 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
AurkaP97477 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AurkaP97477 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AurkaP97477 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AurkaP97477 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AurkaP97477 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AurkaP97477 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AurkaP97477 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
AurkaP97477 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AurkaP97477 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AurkaP97477 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
AurkaP97477 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
AurkaP97477 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AurkaP97477 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AurkaP97477 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
AurkaP97477 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
AurkaP97477 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
AurkaP97477 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
AurkaP97477 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
AurkaP97477 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AurkaP97477 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AurkaP97477 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AurkaP97477 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AurkaP97477 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms