Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nbr1P97432 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nbr1P97432 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nbr1P97432 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nbr1P97432 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nbr1P97432 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nbr1P97432 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nbr1P97432 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nbr1P97432 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nbr1P97432 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nbr1P97432 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nbr1P97432 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Nbr1P97432 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nbr1P97432 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nbr1P97432 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nbr1P97432 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nbr1P97432 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nbr1P97432 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms