Protein–RNA interactions for Protein: P97299

Sfrp2, Secreted frizzled-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp2P97299 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfrp2P97299 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfrp2P97299 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfrp2P97299 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfrp2P97299 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfrp2P97299 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfrp2P97299 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfrp2P97299 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfrp2P97299 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfrp2P97299 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfrp2P97299 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfrp2P97299 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfrp2P97299 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfrp2P97299 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfrp2P97299 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp2P97299 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp2P97299 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp2P97299 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp2P97299 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp2P97299 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp2P97299 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp2P97299 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp2P97299 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp2P97299 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp2P97299 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp2P97299 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp2P97299 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp2P97299 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp2P97299 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp2P97299 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp2P97299 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp2P97299 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp2P97299 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp2P97299 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp2P97299 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp2P97299 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp2P97299 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfrp2P97299 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfrp2P97299 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfrp2P97299 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfrp2P97299 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfrp2P97299 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfrp2P97299 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfrp2P97299 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfrp2P97299 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfrp2P97299 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfrp2P97299 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfrp2P97299 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfrp2P97299 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfrp2P97299 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfrp2P97299 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfrp2P97299 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfrp2P97299 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfrp2P97299 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfrp2P97299 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfrp2P97299 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfrp2P97299 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfrp2P97299 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfrp2P97299 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms