Protein–RNA interactions for Protein: P70211

Dcc, Netrin receptor DCC, mousemouse

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DccP70211 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DccP70211 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DccP70211 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DccP70211 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DccP70211 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DccP70211 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DccP70211 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DccP70211 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DccP70211 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DccP70211 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DccP70211 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DccP70211 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DccP70211 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DccP70211 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
DccP70211 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DccP70211 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DccP70211 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DccP70211 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DccP70211 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
DccP70211 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DccP70211 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DccP70211 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DccP70211 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
DccP70211 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DccP70211 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DccP70211 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DccP70211 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DccP70211 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DccP70211 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DccP70211 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DccP70211 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DccP70211 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DccP70211 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DccP70211 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DccP70211 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
DccP70211 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DccP70211 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DccP70211 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DccP70211 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DccP70211 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DccP70211 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DccP70211 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DccP70211 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DccP70211 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DccP70211 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DccP70211 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DccP70211 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DccP70211 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DccP70211 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DccP70211 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DccP70211 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DccP70211 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
DccP70211 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DccP70211 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DccP70211 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DccP70211 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DccP70211 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DccP70211 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DccP70211 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DccP70211 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DccP70211 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DccP70211 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DccP70211 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
DccP70211 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DccP70211 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DccP70211 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DccP70211 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DccP70211 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DccP70211 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DccP70211 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DccP70211 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DccP70211 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
DccP70211 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
DccP70211 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
DccP70211 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
DccP70211 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
DccP70211 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DccP70211 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DccP70211 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DccP70211 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DccP70211 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DccP70211 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
DccP70211 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DccP70211 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DccP70211 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DccP70211 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DccP70211 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DccP70211 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DccP70211 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
DccP70211 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
DccP70211 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DccP70211 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DccP70211 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DccP70211 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DccP70211 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DccP70211 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DccP70211 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DccP70211 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DccP70211 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DccP70211 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms