Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrig1P70193 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lrig1P70193 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrig1P70193 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrig1P70193 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrig1P70193 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrig1P70193 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrig1P70193 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrig1P70193 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrig1P70193 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrig1P70193 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrig1P70193 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrig1P70193 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrig1P70193 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrig1P70193 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrig1P70193 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrig1P70193 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrig1P70193 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrig1P70193 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrig1P70193 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrig1P70193 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrig1P70193 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrig1P70193 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrig1P70193 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrig1P70193 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrig1P70193 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrig1P70193 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrig1P70193 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrig1P70193 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrig1P70193 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrig1P70193 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrig1P70193 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrig1P70193 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrig1P70193 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrig1P70193 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrig1P70193 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrig1P70193 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrig1P70193 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrig1P70193 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrig1P70193 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms