Protein–RNA interactions for Protein: P63268

Actg2, Actin, gamma-enteric smooth muscle, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actg2P63268 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Actg2P63268 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Actg2P63268 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Actg2P63268 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Actg2P63268 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Actg2P63268 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Actg2P63268 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Actg2P63268 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Actg2P63268 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Actg2P63268 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Actg2P63268 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Actg2P63268 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Actg2P63268 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Actg2P63268 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Actg2P63268 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Actg2P63268 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Actg2P63268 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Actg2P63268 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Actg2P63268 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Actg2P63268 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Actg2P63268 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Actg2P63268 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Actg2P63268 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Actg2P63268 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Actg2P63268 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Actg2P63268 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Actg2P63268 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Actg2P63268 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Actg2P63268 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Actg2P63268 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Actg2P63268 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Actg2P63268 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Actg2P63268 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Actg2P63268 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Actg2P63268 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Actg2P63268 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Actg2P63268 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Actg2P63268 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Actg2P63268 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Actg2P63268 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Actg2P63268 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Actg2P63268 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Actg2P63268 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Actg2P63268 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Actg2P63268 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Actg2P63268 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Actg2P63268 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Actg2P63268 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Actg2P63268 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Actg2P63268 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Actg2P63268 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Actg2P63268 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Actg2P63268 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Actg2P63268 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Actg2P63268 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Actg2P63268 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Actg2P63268 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Actg2P63268 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Actg2P63268 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Actg2P63268 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Actg2P63268 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Actg2P63268 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Actg2P63268 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Actg2P63268 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Actg2P63268 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Actg2P63268 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Actg2P63268 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Actg2P63268 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Actg2P63268 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Actg2P63268 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Actg2P63268 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Actg2P63268 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Actg2P63268 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Actg2P63268 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Actg2P63268 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Actg2P63268 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actg2P63268 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actg2P63268 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actg2P63268 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actg2P63268 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actg2P63268 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actg2P63268 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actg2P63268 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Actg2P63268 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Actg2P63268 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Actg2P63268 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Actg2P63268 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Actg2P63268 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Actg2P63268 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Actg2P63268 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Actg2P63268 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Actg2P63268 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Actg2P63268 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Actg2P63268 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Actg2P63268 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Actg2P63268 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Actg2P63268 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Actg2P63268 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Actg2P63268 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Actg2P63268 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms