Protein–RNA interactions for Protein: P62737

Acta2, Actin, aortic smooth muscle, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta2P62737 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Acta2P62737 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Acta2P62737 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Acta2P62737 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Acta2P62737 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Acta2P62737 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Acta2P62737 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Acta2P62737 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Acta2P62737 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Acta2P62737 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Acta2P62737 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Acta2P62737 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Acta2P62737 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Acta2P62737 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Acta2P62737 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Acta2P62737 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Acta2P62737 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Acta2P62737 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Acta2P62737 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Acta2P62737 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Acta2P62737 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Acta2P62737 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Acta2P62737 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Acta2P62737 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Acta2P62737 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Acta2P62737 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Acta2P62737 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Acta2P62737 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Acta2P62737 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Acta2P62737 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Acta2P62737 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Acta2P62737 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Acta2P62737 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Acta2P62737 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Acta2P62737 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Acta2P62737 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Acta2P62737 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Acta2P62737 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Acta2P62737 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Acta2P62737 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Acta2P62737 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Acta2P62737 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Acta2P62737 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Acta2P62737 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Acta2P62737 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Acta2P62737 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Acta2P62737 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Acta2P62737 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Acta2P62737 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Acta2P62737 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Acta2P62737 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Acta2P62737 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Acta2P62737 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Acta2P62737 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Acta2P62737 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Acta2P62737 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Acta2P62737 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Acta2P62737 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Acta2P62737 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Acta2P62737 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Acta2P62737 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Acta2P62737 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Acta2P62737 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Acta2P62737 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Acta2P62737 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Acta2P62737 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Acta2P62737 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Acta2P62737 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Acta2P62737 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Acta2P62737 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Acta2P62737 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Acta2P62737 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Acta2P62737 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Acta2P62737 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Acta2P62737 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Acta2P62737 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acta2P62737 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acta2P62737 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acta2P62737 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acta2P62737 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acta2P62737 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acta2P62737 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acta2P62737 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Acta2P62737 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acta2P62737 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acta2P62737 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acta2P62737 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acta2P62737 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Acta2P62737 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acta2P62737 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acta2P62737 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acta2P62737 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acta2P62737 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acta2P62737 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Acta2P62737 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acta2P62737 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acta2P62737 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acta2P62737 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acta2P62737 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Acta2P62737 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms