Protein–RNA interactions for Protein: P62080

Tspan5, Tetraspanin-5, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan5P62080 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tspan5P62080 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tspan5P62080 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tspan5P62080 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tspan5P62080 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tspan5P62080 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspan5P62080 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspan5P62080 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspan5P62080 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspan5P62080 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspan5P62080 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspan5P62080 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspan5P62080 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspan5P62080 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspan5P62080 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tspan5P62080 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tspan5P62080 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tspan5P62080 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tspan5P62080 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tspan5P62080 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tspan5P62080 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tspan5P62080 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tspan5P62080 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tspan5P62080 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tspan5P62080 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tspan5P62080 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tspan5P62080 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan5P62080 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan5P62080 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan5P62080 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan5P62080 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan5P62080 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan5P62080 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan5P62080 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan5P62080 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan5P62080 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan5P62080 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan5P62080 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan5P62080 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan5P62080 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan5P62080 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan5P62080 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan5P62080 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan5P62080 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan5P62080 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan5P62080 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan5P62080 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan5P62080 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan5P62080 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan5P62080 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan5P62080 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan5P62080 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan5P62080 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan5P62080 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan5P62080 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan5P62080 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan5P62080 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan5P62080 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan5P62080 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan5P62080 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan5P62080 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan5P62080 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan5P62080 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan5P62080 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan5P62080 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan5P62080 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tspan5P62080 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tspan5P62080 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tspan5P62080 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tspan5P62080 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tspan5P62080 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tspan5P62080 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tspan5P62080 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tspan5P62080 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tspan5P62080 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tspan5P62080 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tspan5P62080 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tspan5P62080 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tspan5P62080 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tspan5P62080 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tspan5P62080 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tspan5P62080 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan5P62080 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan5P62080 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan5P62080 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan5P62080 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan5P62080 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan5P62080 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan5P62080 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan5P62080 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan5P62080 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan5P62080 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan5P62080 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan5P62080 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan5P62080 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan5P62080 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan5P62080 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan5P62080 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan5P62080 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan5P62080 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms