Protein–RNA interactions for Protein: P57722

Pcbp3, Poly(rC)-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp3P57722 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcbp3P57722 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pcbp3P57722 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pcbp3P57722 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcbp3P57722 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcbp3P57722 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcbp3P57722 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcbp3P57722 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcbp3P57722 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcbp3P57722 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcbp3P57722 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcbp3P57722 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcbp3P57722 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcbp3P57722 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcbp3P57722 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcbp3P57722 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcbp3P57722 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcbp3P57722 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcbp3P57722 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcbp3P57722 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcbp3P57722 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcbp3P57722 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcbp3P57722 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcbp3P57722 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcbp3P57722 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcbp3P57722 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcbp3P57722 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms