Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bace1P56818 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bace1P56818 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bace1P56818 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bace1P56818 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bace1P56818 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Bace1P56818 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Bace1P56818 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Bace1P56818 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bace1P56818 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bace1P56818 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bace1P56818 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bace1P56818 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bace1P56818 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bace1P56818 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bace1P56818 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bace1P56818 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bace1P56818 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Bace1P56818 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Bace1P56818 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bace1P56818 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bace1P56818 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bace1P56818 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bace1P56818 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Bace1P56818 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bace1P56818 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bace1P56818 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bace1P56818 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bace1P56818 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bace1P56818 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bace1P56818 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bace1P56818 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bace1P56818 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bace1P56818 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bace1P56818 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bace1P56818 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Bace1P56818 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bace1P56818 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bace1P56818 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bace1P56818 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bace1P56818 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bace1P56818 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bace1P56818 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bace1P56818 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bace1P56818 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bace1P56818 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bace1P56818 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bace1P56818 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bace1P56818 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bace1P56818 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bace1P56818 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bace1P56818 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bace1P56818 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bace1P56818 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bace1P56818 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bace1P56818 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bace1P56818 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bace1P56818 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bace1P56818 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bace1P56818 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bace1P56818 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bace1P56818 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Bace1P56818 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bace1P56818 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bace1P56818 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bace1P56818 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bace1P56818 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bace1P56818 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bace1P56818 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bace1P56818 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bace1P56818 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bace1P56818 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bace1P56818 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bace1P56818 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Bace1P56818 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Bace1P56818 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bace1P56818 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bace1P56818 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bace1P56818 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bace1P56818 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bace1P56818 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bace1P56818 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bace1P56818 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bace1P56818 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bace1P56818 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Bace1P56818 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bace1P56818 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bace1P56818 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bace1P56818 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bace1P56818 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bace1P56818 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bace1P56818 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Bace1P56818 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bace1P56818 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bace1P56818 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bace1P56818 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bace1P56818 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bace1P56818 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bace1P56818 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bace1P56818 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms