Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pex2P55098 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pex2P55098 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pex2P55098 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pex2P55098 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pex2P55098 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pex2P55098 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pex2P55098 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pex2P55098 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pex2P55098 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pex2P55098 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pex2P55098 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pex2P55098 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pex2P55098 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pex2P55098 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pex2P55098 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pex2P55098 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pex2P55098 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pex2P55098 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pex2P55098 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pex2P55098 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pex2P55098 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Pex2P55098 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pex2P55098 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pex2P55098 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pex2P55098 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pex2P55098 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pex2P55098 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pex2P55098 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Pex2P55098 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Pex2P55098 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pex2P55098 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pex2P55098 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pex2P55098 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pex2P55098 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pex2P55098 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pex2P55098 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pex2P55098 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pex2P55098 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pex2P55098 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pex2P55098 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pex2P55098 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pex2P55098 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pex2P55098 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pex2P55098 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pex2P55098 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pex2P55098 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pex2P55098 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pex2P55098 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pex2P55098 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pex2P55098 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pex2P55098 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Pex2P55098 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pex2P55098 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pex2P55098 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pex2P55098 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pex2P55098 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pex2P55098 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pex2P55098 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pex2P55098 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pex2P55098 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pex2P55098 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Pex2P55098 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pex2P55098 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pex2P55098 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pex2P55098 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pex2P55098 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pex2P55098 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pex2P55098 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pex2P55098 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pex2P55098 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pex2P55098 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pex2P55098 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Pex2P55098 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pex2P55098 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pex2P55098 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pex2P55098 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pex2P55098 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pex2P55098 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Pex2P55098 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pex2P55098 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pex2P55098 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pex2P55098 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pex2P55098 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pex2P55098 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pex2P55098 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pex2P55098 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pex2P55098 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pex2P55098 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pex2P55098 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pex2P55098 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pex2P55098 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pex2P55098 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pex2P55098 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pex2P55098 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pex2P55098 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pex2P55098 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pex2P55098 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pex2P55098 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pex2P55098 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms