Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RabggtbP53612 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RabggtbP53612 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RabggtbP53612 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RabggtbP53612 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RabggtbP53612 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RabggtbP53612 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RabggtbP53612 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RabggtbP53612 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RabggtbP53612 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RabggtbP53612 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RabggtbP53612 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
RabggtbP53612 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RabggtbP53612 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RabggtbP53612 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RabggtbP53612 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RabggtbP53612 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RabggtbP53612 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RabggtbP53612 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RabggtbP53612 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RabggtbP53612 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RabggtbP53612 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RabggtbP53612 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RabggtbP53612 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RabggtbP53612 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RabggtbP53612 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RabggtbP53612 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RabggtbP53612 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RabggtbP53612 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RabggtbP53612 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RabggtbP53612 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RabggtbP53612 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RabggtbP53612 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RabggtbP53612 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RabggtbP53612 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RabggtbP53612 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RabggtbP53612 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RabggtbP53612 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RabggtbP53612 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RabggtbP53612 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RabggtbP53612 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RabggtbP53612 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RabggtbP53612 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RabggtbP53612 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RabggtbP53612 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RabggtbP53612 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RabggtbP53612 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RabggtbP53612 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RabggtbP53612 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RabggtbP53612 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RabggtbP53612 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RabggtbP53612 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RabggtbP53612 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RabggtbP53612 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RabggtbP53612 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
RabggtbP53612 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RabggtbP53612 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
RabggtbP53612 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RabggtbP53612 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RabggtbP53612 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RabggtbP53612 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RabggtbP53612 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RabggtbP53612 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RabggtbP53612 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RabggtbP53612 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RabggtbP53612 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RabggtbP53612 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RabggtbP53612 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RabggtbP53612 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RabggtbP53612 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
RabggtbP53612 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RabggtbP53612 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RabggtbP53612 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RabggtbP53612 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RabggtbP53612 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RabggtbP53612 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RabggtbP53612 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RabggtbP53612 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RabggtbP53612 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RabggtbP53612 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RabggtbP53612 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RabggtbP53612 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RabggtbP53612 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RabggtbP53612 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RabggtbP53612 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RabggtbP53612 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RabggtbP53612 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RabggtbP53612 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RabggtbP53612 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RabggtbP53612 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RabggtbP53612 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
RabggtbP53612 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RabggtbP53612 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
RabggtbP53612 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RabggtbP53612 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RabggtbP53612 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RabggtbP53612 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
RabggtbP53612 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
RabggtbP53612 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RabggtbP53612 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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