Protein–RNA interactions for Protein: P51910

Apod, Apolipoprotein D, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApodP51910 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ApodP51910 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ApodP51910 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ApodP51910 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ApodP51910 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ApodP51910 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ApodP51910 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ApodP51910 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ApodP51910 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ApodP51910 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ApodP51910 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ApodP51910 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ApodP51910 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ApodP51910 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ApodP51910 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ApodP51910 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ApodP51910 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ApodP51910 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ApodP51910 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ApodP51910 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ApodP51910 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ApodP51910 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ApodP51910 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ApodP51910 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ApodP51910 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ApodP51910 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ApodP51910 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ApodP51910 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ApodP51910 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ApodP51910 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ApodP51910 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ApodP51910 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ApodP51910 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ApodP51910 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ApodP51910 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ApodP51910 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ApodP51910 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ApodP51910 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ApodP51910 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ApodP51910 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ApodP51910 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ApodP51910 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ApodP51910 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ApodP51910 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ApodP51910 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ApodP51910 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ApodP51910 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ApodP51910 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ApodP51910 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ApodP51910 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ApodP51910 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ApodP51910 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ApodP51910 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ApodP51910 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ApodP51910 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ApodP51910 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ApodP51910 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ApodP51910 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ApodP51910 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ApodP51910 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ApodP51910 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ApodP51910 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ApodP51910 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ApodP51910 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ApodP51910 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ApodP51910 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ApodP51910 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ApodP51910 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ApodP51910 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ApodP51910 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ApodP51910 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ApodP51910 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ApodP51910 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ApodP51910 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ApodP51910 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ApodP51910 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ApodP51910 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ApodP51910 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ApodP51910 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ApodP51910 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ApodP51910 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ApodP51910 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ApodP51910 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ApodP51910 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ApodP51910 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ApodP51910 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ApodP51910 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ApodP51910 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ApodP51910 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ApodP51910 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ApodP51910 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ApodP51910 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ApodP51910 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ApodP51910 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ApodP51910 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ApodP51910 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ApodP51910 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ApodP51910 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ApodP51910 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ApodP51910 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.7 ms