Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccr5P51682 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccr5P51682 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccr5P51682 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccr5P51682 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccr5P51682 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccr5P51682 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccr5P51682 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccr5P51682 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccr5P51682 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccr5P51682 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccr5P51682 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccr5P51682 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccr5P51682 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccr5P51682 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccr5P51682 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccr5P51682 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccr5P51682 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccr5P51682 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccr5P51682 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccr5P51682 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccr5P51682 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccr5P51682 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccr5P51682 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccr5P51682 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccr5P51682 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccr5P51682 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccr5P51682 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccr5P51682 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccr5P51682 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccr5P51682 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccr5P51682 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccr5P51682 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccr5P51682 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccr5P51682 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccr5P51682 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccr5P51682 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccr5P51682 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccr5P51682 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ccr5P51682 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccr5P51682 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccr5P51682 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccr5P51682 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccr5P51682 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccr5P51682 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccr5P51682 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccr5P51682 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccr5P51682 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccr5P51682 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccr5P51682 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccr5P51682 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccr5P51682 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccr5P51682 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccr5P51682 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccr5P51682 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccr5P51682 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccr5P51682 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccr5P51682 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccr5P51682 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccr5P51682 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccr5P51682 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccr5P51682 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccr5P51682 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccr5P51682 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccr5P51682 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccr5P51682 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccr5P51682 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccr5P51682 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccr5P51682 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccr5P51682 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccr5P51682 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccr5P51682 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccr5P51682 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccr5P51682 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccr5P51682 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccr5P51682 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccr5P51682 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccr5P51682 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccr5P51682 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccr5P51682 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccr5P51682 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccr5P51682 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccr5P51682 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccr5P51682 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccr5P51682 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccr5P51682 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccr5P51682 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccr5P51682 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms