Protein–RNA interactions for Protein: P51680

Ccr4, C-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr4P51680 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccr4P51680 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccr4P51680 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccr4P51680 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccr4P51680 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccr4P51680 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccr4P51680 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccr4P51680 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccr4P51680 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccr4P51680 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccr4P51680 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccr4P51680 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccr4P51680 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccr4P51680 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccr4P51680 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccr4P51680 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccr4P51680 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccr4P51680 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccr4P51680 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccr4P51680 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccr4P51680 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccr4P51680 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccr4P51680 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccr4P51680 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccr4P51680 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccr4P51680 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccr4P51680 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccr4P51680 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccr4P51680 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccr4P51680 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccr4P51680 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccr4P51680 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccr4P51680 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccr4P51680 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccr4P51680 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccr4P51680 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccr4P51680 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccr4P51680 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccr4P51680 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccr4P51680 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccr4P51680 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccr4P51680 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccr4P51680 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccr4P51680 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccr4P51680 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccr4P51680 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccr4P51680 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccr4P51680 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccr4P51680 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccr4P51680 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccr4P51680 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccr4P51680 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccr4P51680 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccr4P51680 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccr4P51680 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccr4P51680 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccr4P51680 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccr4P51680 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccr4P51680 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccr4P51680 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccr4P51680 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccr4P51680 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccr4P51680 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccr4P51680 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccr4P51680 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccr4P51680 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccr4P51680 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccr4P51680 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccr4P51680 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccr4P51680 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccr4P51680 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccr4P51680 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccr4P51680 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccr4P51680 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccr4P51680 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccr4P51680 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccr4P51680 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccr4P51680 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccr4P51680 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccr4P51680 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccr4P51680 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccr4P51680 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccr4P51680 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccr4P51680 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccr4P51680 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccr4P51680 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccr4P51680 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccr4P51680 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccr4P51680 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccr4P51680 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccr4P51680 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccr4P51680 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccr4P51680 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccr4P51680 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccr4P51680 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccr4P51680 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccr4P51680 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccr4P51680 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccr4P51680 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccr4P51680 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms