Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CntfP51642 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CntfP51642 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CntfP51642 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CntfP51642 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CntfP51642 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CntfP51642 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CntfP51642 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CntfP51642 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CntfP51642 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CntfP51642 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CntfP51642 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CntfP51642 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CntfP51642 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CntfP51642 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CntfP51642 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CntfP51642 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CntfP51642 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CntfP51642 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CntfP51642 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CntfP51642 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CntfP51642 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CntfP51642 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CntfP51642 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CntfP51642 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CntfP51642 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CntfP51642 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CntfP51642 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CntfP51642 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CntfP51642 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CntfP51642 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CntfP51642 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CntfP51642 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CntfP51642 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CntfP51642 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CntfP51642 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CntfP51642 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CntfP51642 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CntfP51642 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CntfP51642 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CntfP51642 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CntfP51642 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CntfP51642 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CntfP51642 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CntfP51642 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CntfP51642 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CntfP51642 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CntfP51642 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CntfP51642 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CntfP51642 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CntfP51642 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CntfP51642 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CntfP51642 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CntfP51642 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CntfP51642 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CntfP51642 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CntfP51642 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CntfP51642 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CntfP51642 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CntfP51642 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CntfP51642 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CntfP51642 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CntfP51642 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CntfP51642 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CntfP51642 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CntfP51642 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CntfP51642 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CntfP51642 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CntfP51642 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CntfP51642 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CntfP51642 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CntfP51642 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CntfP51642 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CntfP51642 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CntfP51642 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CntfP51642 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CntfP51642 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CntfP51642 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CntfP51642 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CntfP51642 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CntfP51642 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CntfP51642 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CntfP51642 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CntfP51642 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CntfP51642 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CntfP51642 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CntfP51642 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CntfP51642 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CntfP51642 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CntfP51642 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CntfP51642 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CntfP51642 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CntfP51642 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CntfP51642 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CntfP51642 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CntfP51642 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CntfP51642 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CntfP51642 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CntfP51642 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CntfP51642 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms