Protein–RNA interactions for Protein: P50752

Tnnt2, Troponin T, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt2P50752 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnnt2P50752 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnnt2P50752 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnnt2P50752 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnnt2P50752 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnnt2P50752 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnnt2P50752 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnnt2P50752 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnnt2P50752 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnnt2P50752 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnnt2P50752 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnnt2P50752 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnnt2P50752 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnnt2P50752 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tnnt2P50752 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tnnt2P50752 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tnnt2P50752 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tnnt2P50752 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnnt2P50752 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnnt2P50752 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnnt2P50752 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnnt2P50752 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnnt2P50752 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnnt2P50752 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnnt2P50752 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnnt2P50752 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnnt2P50752 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnnt2P50752 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnnt2P50752 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnnt2P50752 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnnt2P50752 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnnt2P50752 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnnt2P50752 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnnt2P50752 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnnt2P50752 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnnt2P50752 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnnt2P50752 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnnt2P50752 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnnt2P50752 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnnt2P50752 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnnt2P50752 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnnt2P50752 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnnt2P50752 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnnt2P50752 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnnt2P50752 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnnt2P50752 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnnt2P50752 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnnt2P50752 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnnt2P50752 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnnt2P50752 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnnt2P50752 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnnt2P50752 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnnt2P50752 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnnt2P50752 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnnt2P50752 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnnt2P50752 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnnt2P50752 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnnt2P50752 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnnt2P50752 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnnt2P50752 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnnt2P50752 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnnt2P50752 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnnt2P50752 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnnt2P50752 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnnt2P50752 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnnt2P50752 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnnt2P50752 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnnt2P50752 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnnt2P50752 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnnt2P50752 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnnt2P50752 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnnt2P50752 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnnt2P50752 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnnt2P50752 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnnt2P50752 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnnt2P50752 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnnt2P50752 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnnt2P50752 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnnt2P50752 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnnt2P50752 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tnnt2P50752 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tnnt2P50752 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tnnt2P50752 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tnnt2P50752 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnnt2P50752 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnnt2P50752 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnnt2P50752 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnnt2P50752 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnnt2P50752 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnnt2P50752 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnnt2P50752 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnnt2P50752 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnnt2P50752 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnnt2P50752 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnnt2P50752 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnnt2P50752 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnnt2P50752 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnnt2P50752 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnnt2P50752 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnnt2P50752 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms