Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cav1P49817 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cav1P49817 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cav1P49817 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cav1P49817 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cav1P49817 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cav1P49817 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cav1P49817 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cav1P49817 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cav1P49817 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cav1P49817 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cav1P49817 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cav1P49817 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cav1P49817 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cav1P49817 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cav1P49817 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cav1P49817 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cav1P49817 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cav1P49817 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cav1P49817 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cav1P49817 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cav1P49817 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cav1P49817 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cav1P49817 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cav1P49817 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cav1P49817 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cav1P49817 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cav1P49817 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cav1P49817 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cav1P49817 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cav1P49817 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cav1P49817 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cav1P49817 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cav1P49817 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cav1P49817 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cav1P49817 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cav1P49817 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cav1P49817 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cav1P49817 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cav1P49817 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Cav1P49817 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cav1P49817 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cav1P49817 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cav1P49817 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cav1P49817 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cav1P49817 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cav1P49817 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cav1P49817 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cav1P49817 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cav1P49817 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cav1P49817 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cav1P49817 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cav1P49817 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cav1P49817 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cav1P49817 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cav1P49817 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cav1P49817 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cav1P49817 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cav1P49817 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cav1P49817 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cav1P49817 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cav1P49817 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cav1P49817 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cav1P49817 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cav1P49817 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Cav1P49817 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cav1P49817 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cav1P49817 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cav1P49817 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cav1P49817 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cav1P49817 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cav1P49817 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cav1P49817 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cav1P49817 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cav1P49817 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cav1P49817 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cav1P49817 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cav1P49817 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cav1P49817 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cav1P49817 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cav1P49817 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cav1P49817 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cav1P49817 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cav1P49817 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cav1P49817 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cav1P49817 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cav1P49817 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cav1P49817 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cav1P49817 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cav1P49817 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cav1P49817 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cav1P49817 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cav1P49817 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cav1P49817 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cav1P49817 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cav1P49817 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cav1P49817 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cav1P49817 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cav1P49817 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cav1P49817 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms