Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtpreP49446 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PtpreP49446 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PtpreP49446 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PtpreP49446 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtpreP49446 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtpreP49446 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtpreP49446 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtpreP49446 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PtpreP49446 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PtpreP49446 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PtpreP49446 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtpreP49446 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtpreP49446 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtpreP49446 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtpreP49446 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtpreP49446 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtpreP49446 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtpreP49446 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtpreP49446 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PtpreP49446 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtpreP49446 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtpreP49446 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtpreP49446 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtpreP49446 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtpreP49446 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtpreP49446 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtpreP49446 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PtpreP49446 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtpreP49446 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtpreP49446 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtpreP49446 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtpreP49446 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtpreP49446 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtpreP49446 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtpreP49446 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtpreP49446 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtpreP49446 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtpreP49446 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtpreP49446 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtpreP49446 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PtpreP49446 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtpreP49446 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtpreP49446 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtpreP49446 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtpreP49446 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtpreP49446 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtpreP49446 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PtpreP49446 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtpreP49446 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtpreP49446 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtpreP49446 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtpreP49446 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
PtpreP49446 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtpreP49446 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtpreP49446 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtpreP49446 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtpreP49446 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtpreP49446 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PtpreP49446 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtpreP49446 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtpreP49446 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtpreP49446 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PtpreP49446 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PtpreP49446 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PtpreP49446 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PtpreP49446 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PtpreP49446 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PtpreP49446 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PtpreP49446 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PtpreP49446 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PtpreP49446 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtpreP49446 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtpreP49446 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtpreP49446 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtpreP49446 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtpreP49446 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtpreP49446 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtpreP49446 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtpreP49446 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtpreP49446 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PtpreP49446 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtpreP49446 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtpreP49446 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtpreP49446 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtpreP49446 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PtpreP49446 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtpreP49446 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtpreP49446 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtpreP49446 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtpreP49446 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtpreP49446 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtpreP49446 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtpreP49446 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtpreP49446 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtpreP49446 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtpreP49446 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtpreP49446 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtpreP49446 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtpreP49446 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms