Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbp3P49194 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbp3P49194 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbp3P49194 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbp3P49194 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rbp3P49194 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbp3P49194 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbp3P49194 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbp3P49194 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbp3P49194 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbp3P49194 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbp3P49194 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbp3P49194 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbp3P49194 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbp3P49194 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rbp3P49194 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbp3P49194 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbp3P49194 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbp3P49194 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbp3P49194 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbp3P49194 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbp3P49194 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbp3P49194 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbp3P49194 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbp3P49194 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbp3P49194 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbp3P49194 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbp3P49194 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbp3P49194 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbp3P49194 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbp3P49194 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbp3P49194 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbp3P49194 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbp3P49194 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbp3P49194 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbp3P49194 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbp3P49194 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbp3P49194 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbp3P49194 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbp3P49194 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbp3P49194 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbp3P49194 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rbp3P49194 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rbp3P49194 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rbp3P49194 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rbp3P49194 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rbp3P49194 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rbp3P49194 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rbp3P49194 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rbp3P49194 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rbp3P49194 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rbp3P49194 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rbp3P49194 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbp3P49194 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbp3P49194 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbp3P49194 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbp3P49194 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbp3P49194 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbp3P49194 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbp3P49194 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbp3P49194 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbp3P49194 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbp3P49194 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbp3P49194 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbp3P49194 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbp3P49194 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbp3P49194 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbp3P49194 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbp3P49194 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbp3P49194 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbp3P49194 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Rbp3P49194 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rbp3P49194 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rbp3P49194 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rbp3P49194 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rbp3P49194 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rbp3P49194 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rbp3P49194 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rbp3P49194 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbp3P49194 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbp3P49194 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbp3P49194 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbp3P49194 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbp3P49194 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbp3P49194 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbp3P49194 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbp3P49194 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbp3P49194 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbp3P49194 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbp3P49194 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbp3P49194 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbp3P49194 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbp3P49194 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbp3P49194 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbp3P49194 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbp3P49194 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rbp3P49194 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rbp3P49194 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rbp3P49194 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rbp3P49194 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms