Protein–RNA interactions for Protein: P48299

Edn3, Endothelin-3, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn3P48299 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Edn3P48299 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Edn3P48299 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Edn3P48299 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Edn3P48299 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Edn3P48299 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Edn3P48299 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Edn3P48299 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Edn3P48299 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Edn3P48299 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Edn3P48299 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Edn3P48299 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Edn3P48299 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Edn3P48299 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Edn3P48299 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Edn3P48299 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Edn3P48299 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Edn3P48299 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Edn3P48299 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Edn3P48299 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Edn3P48299 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Edn3P48299 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Edn3P48299 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Edn3P48299 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Edn3P48299 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Edn3P48299 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Edn3P48299 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Edn3P48299 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Edn3P48299 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Edn3P48299 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Edn3P48299 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Edn3P48299 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Edn3P48299 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Edn3P48299 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Edn3P48299 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Edn3P48299 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Edn3P48299 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Edn3P48299 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Edn3P48299 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Edn3P48299 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Edn3P48299 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Edn3P48299 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Edn3P48299 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Edn3P48299 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Edn3P48299 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Edn3P48299 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Edn3P48299 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Edn3P48299 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Edn3P48299 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Edn3P48299 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Edn3P48299 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Edn3P48299 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Edn3P48299 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Edn3P48299 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Edn3P48299 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Edn3P48299 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Edn3P48299 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Edn3P48299 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Edn3P48299 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Edn3P48299 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Edn3P48299 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Edn3P48299 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Edn3P48299 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Edn3P48299 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Edn3P48299 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Edn3P48299 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Edn3P48299 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Edn3P48299 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Edn3P48299 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Edn3P48299 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Edn3P48299 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Edn3P48299 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Edn3P48299 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Edn3P48299 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Edn3P48299 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Edn3P48299 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Edn3P48299 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Edn3P48299 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Edn3P48299 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Edn3P48299 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Edn3P48299 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Edn3P48299 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms