Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VdrP48281 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VdrP48281 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VdrP48281 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VdrP48281 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VdrP48281 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
VdrP48281 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VdrP48281 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VdrP48281 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VdrP48281 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VdrP48281 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VdrP48281 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VdrP48281 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VdrP48281 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VdrP48281 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VdrP48281 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VdrP48281 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VdrP48281 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VdrP48281 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VdrP48281 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VdrP48281 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VdrP48281 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VdrP48281 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VdrP48281 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VdrP48281 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VdrP48281 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
VdrP48281 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VdrP48281 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VdrP48281 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
VdrP48281 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VdrP48281 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VdrP48281 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VdrP48281 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VdrP48281 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VdrP48281 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VdrP48281 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VdrP48281 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VdrP48281 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VdrP48281 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VdrP48281 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VdrP48281 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VdrP48281 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VdrP48281 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
VdrP48281 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VdrP48281 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VdrP48281 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VdrP48281 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VdrP48281 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VdrP48281 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VdrP48281 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VdrP48281 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VdrP48281 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VdrP48281 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VdrP48281 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VdrP48281 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VdrP48281 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VdrP48281 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
VdrP48281 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VdrP48281 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VdrP48281 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VdrP48281 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VdrP48281 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VdrP48281 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VdrP48281 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VdrP48281 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VdrP48281 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VdrP48281 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VdrP48281 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VdrP48281 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VdrP48281 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VdrP48281 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VdrP48281 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VdrP48281 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VdrP48281 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VdrP48281 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VdrP48281 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VdrP48281 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VdrP48281 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VdrP48281 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VdrP48281 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VdrP48281 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VdrP48281 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VdrP48281 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VdrP48281 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VdrP48281 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VdrP48281 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
VdrP48281 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VdrP48281 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VdrP48281 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VdrP48281 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VdrP48281 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VdrP48281 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VdrP48281 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VdrP48281 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VdrP48281 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VdrP48281 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VdrP48281 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VdrP48281 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VdrP48281 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VdrP48281 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms