Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rab11bP46638 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab11bP46638 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab11bP46638 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab11bP46638 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab11bP46638 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab11bP46638 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab11bP46638 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab11bP46638 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab11bP46638 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab11bP46638 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab11bP46638 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab11bP46638 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab11bP46638 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab11bP46638 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab11bP46638 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab11bP46638 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab11bP46638 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab11bP46638 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab11bP46638 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms