Protein–RNA interactions for Protein: P46062

Sipa1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sipa1P46062 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sipa1P46062 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sipa1P46062 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sipa1P46062 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sipa1P46062 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sipa1P46062 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sipa1P46062 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sipa1P46062 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Sipa1P46062 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sipa1P46062 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sipa1P46062 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sipa1P46062 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sipa1P46062 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sipa1P46062 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sipa1P46062 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sipa1P46062 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sipa1P46062 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sipa1P46062 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sipa1P46062 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sipa1P46062 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sipa1P46062 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sipa1P46062 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sipa1P46062 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sipa1P46062 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sipa1P46062 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sipa1P46062 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sipa1P46062 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sipa1P46062 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sipa1P46062 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sipa1P46062 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sipa1P46062 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Sipa1P46062 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sipa1P46062 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sipa1P46062 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sipa1P46062 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sipa1P46062 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sipa1P46062 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sipa1P46062 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Sipa1P46062 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sipa1P46062 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sipa1P46062 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sipa1P46062 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sipa1P46062 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sipa1P46062 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sipa1P46062 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sipa1P46062 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sipa1P46062 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sipa1P46062 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sipa1P46062 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sipa1P46062 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sipa1P46062 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sipa1P46062 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sipa1P46062 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Sipa1P46062 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sipa1P46062 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sipa1P46062 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sipa1P46062 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Sipa1P46062 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sipa1P46062 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sipa1P46062 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sipa1P46062 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sipa1P46062 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sipa1P46062 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sipa1P46062 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Sipa1P46062 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sipa1P46062 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sipa1P46062 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sipa1P46062 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sipa1P46062 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sipa1P46062 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sipa1P46062 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sipa1P46062 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sipa1P46062 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sipa1P46062 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sipa1P46062 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sipa1P46062 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sipa1P46062 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sipa1P46062 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sipa1P46062 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sipa1P46062 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sipa1P46062 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sipa1P46062 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sipa1P46062 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sipa1P46062 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sipa1P46062 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sipa1P46062 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sipa1P46062 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sipa1P46062 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sipa1P46062 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sipa1P46062 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sipa1P46062 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sipa1P46062 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sipa1P46062 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sipa1P46062 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sipa1P46062 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sipa1P46062 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sipa1P46062 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sipa1P46062 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sipa1P46062 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sipa1P46062 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms