Protein–RNA interactions for Protein: P43407

Sdc2, Syndecan-2, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc2P43407 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sdc2P43407 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sdc2P43407 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sdc2P43407 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sdc2P43407 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sdc2P43407 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sdc2P43407 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sdc2P43407 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sdc2P43407 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sdc2P43407 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sdc2P43407 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sdc2P43407 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sdc2P43407 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sdc2P43407 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sdc2P43407 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sdc2P43407 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sdc2P43407 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sdc2P43407 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sdc2P43407 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sdc2P43407 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sdc2P43407 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sdc2P43407 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sdc2P43407 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sdc2P43407 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sdc2P43407 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sdc2P43407 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sdc2P43407 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sdc2P43407 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sdc2P43407 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sdc2P43407 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sdc2P43407 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sdc2P43407 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sdc2P43407 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sdc2P43407 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sdc2P43407 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sdc2P43407 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sdc2P43407 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sdc2P43407 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sdc2P43407 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sdc2P43407 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sdc2P43407 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sdc2P43407 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sdc2P43407 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sdc2P43407 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sdc2P43407 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sdc2P43407 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sdc2P43407 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sdc2P43407 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sdc2P43407 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sdc2P43407 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sdc2P43407 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sdc2P43407 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sdc2P43407 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sdc2P43407 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sdc2P43407 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sdc2P43407 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sdc2P43407 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sdc2P43407 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sdc2P43407 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sdc2P43407 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sdc2P43407 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sdc2P43407 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Sdc2P43407 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sdc2P43407 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sdc2P43407 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sdc2P43407 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sdc2P43407 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sdc2P43407 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sdc2P43407 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sdc2P43407 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sdc2P43407 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sdc2P43407 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sdc2P43407 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sdc2P43407 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sdc2P43407 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sdc2P43407 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sdc2P43407 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sdc2P43407 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sdc2P43407 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sdc2P43407 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sdc2P43407 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sdc2P43407 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sdc2P43407 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sdc2P43407 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sdc2P43407 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sdc2P43407 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sdc2P43407 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sdc2P43407 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sdc2P43407 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sdc2P43407 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sdc2P43407 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sdc2P43407 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sdc2P43407 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sdc2P43407 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sdc2P43407 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sdc2P43407 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sdc2P43407 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Sdc2P43407 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sdc2P43407 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sdc2P43407 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms