Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ItgavP43406 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ItgavP43406 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ItgavP43406 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ItgavP43406 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ItgavP43406 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ItgavP43406 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ItgavP43406 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ItgavP43406 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ItgavP43406 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ItgavP43406 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ItgavP43406 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ItgavP43406 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ItgavP43406 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ItgavP43406 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ItgavP43406 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ItgavP43406 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ItgavP43406 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ItgavP43406 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ItgavP43406 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ItgavP43406 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ItgavP43406 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ItgavP43406 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ItgavP43406 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ItgavP43406 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ItgavP43406 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ItgavP43406 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ItgavP43406 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ItgavP43406 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ItgavP43406 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ItgavP43406 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ItgavP43406 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ItgavP43406 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ItgavP43406 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ItgavP43406 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ItgavP43406 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ItgavP43406 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ItgavP43406 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ItgavP43406 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ItgavP43406 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ItgavP43406 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ItgavP43406 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ItgavP43406 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ItgavP43406 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ItgavP43406 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ItgavP43406 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ItgavP43406 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ItgavP43406 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ItgavP43406 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ItgavP43406 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ItgavP43406 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ItgavP43406 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ItgavP43406 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ItgavP43406 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ItgavP43406 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ItgavP43406 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ItgavP43406 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ItgavP43406 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ItgavP43406 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ItgavP43406 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ItgavP43406 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ItgavP43406 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ItgavP43406 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ItgavP43406 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ItgavP43406 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ItgavP43406 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ItgavP43406 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ItgavP43406 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ItgavP43406 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ItgavP43406 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ItgavP43406 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ItgavP43406 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ItgavP43406 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ItgavP43406 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ItgavP43406 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ItgavP43406 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ItgavP43406 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ItgavP43406 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ItgavP43406 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ItgavP43406 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ItgavP43406 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ItgavP43406 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms