Protein–RNA interactions for Protein: P41164

Etv1, ETS translocation variant 1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv1P41164 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Etv1P41164 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Etv1P41164 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Etv1P41164 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Etv1P41164 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Etv1P41164 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Etv1P41164 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Etv1P41164 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Etv1P41164 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Etv1P41164 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Etv1P41164 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Etv1P41164 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Etv1P41164 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Etv1P41164 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Etv1P41164 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Etv1P41164 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Etv1P41164 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Etv1P41164 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Etv1P41164 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Etv1P41164 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Etv1P41164 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Etv1P41164 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Etv1P41164 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Etv1P41164 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Etv1P41164 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Etv1P41164 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Etv1P41164 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Etv1P41164 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Etv1P41164 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Etv1P41164 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Etv1P41164 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Etv1P41164 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Etv1P41164 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Etv1P41164 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Etv1P41164 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Etv1P41164 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Etv1P41164 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Etv1P41164 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Etv1P41164 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Etv1P41164 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Etv1P41164 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Etv1P41164 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Etv1P41164 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Etv1P41164 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Etv1P41164 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Etv1P41164 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Etv1P41164 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Etv1P41164 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Etv1P41164 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Etv1P41164 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Etv1P41164 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Etv1P41164 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Etv1P41164 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Etv1P41164 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Etv1P41164 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Etv1P41164 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Etv1P41164 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Etv1P41164 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Etv1P41164 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Etv1P41164 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Etv1P41164 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Etv1P41164 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Etv1P41164 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Etv1P41164 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Etv1P41164 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Etv1P41164 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Etv1P41164 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Etv1P41164 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Etv1P41164 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Etv1P41164 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Etv1P41164 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Etv1P41164 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Etv1P41164 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Etv1P41164 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Etv1P41164 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Etv1P41164 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Etv1P41164 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Etv1P41164 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Etv1P41164 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Etv1P41164 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Etv1P41164 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Etv1P41164 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Etv1P41164 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Etv1P41164 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms