Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LtbP41155 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LtbP41155 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LtbP41155 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LtbP41155 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LtbP41155 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LtbP41155 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LtbP41155 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LtbP41155 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LtbP41155 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LtbP41155 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LtbP41155 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LtbP41155 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LtbP41155 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LtbP41155 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LtbP41155 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LtbP41155 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LtbP41155 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LtbP41155 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LtbP41155 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LtbP41155 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LtbP41155 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LtbP41155 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LtbP41155 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LtbP41155 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LtbP41155 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LtbP41155 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LtbP41155 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LtbP41155 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LtbP41155 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LtbP41155 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LtbP41155 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LtbP41155 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LtbP41155 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LtbP41155 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LtbP41155 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LtbP41155 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LtbP41155 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LtbP41155 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LtbP41155 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LtbP41155 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LtbP41155 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LtbP41155 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LtbP41155 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LtbP41155 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LtbP41155 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LtbP41155 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LtbP41155 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LtbP41155 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LtbP41155 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LtbP41155 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LtbP41155 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LtbP41155 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LtbP41155 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LtbP41155 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LtbP41155 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LtbP41155 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LtbP41155 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LtbP41155 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LtbP41155 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LtbP41155 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LtbP41155 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LtbP41155 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LtbP41155 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LtbP41155 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LtbP41155 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LtbP41155 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LtbP41155 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LtbP41155 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LtbP41155 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LtbP41155 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LtbP41155 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LtbP41155 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LtbP41155 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LtbP41155 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LtbP41155 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LtbP41155 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LtbP41155 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LtbP41155 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LtbP41155 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LtbP41155 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LtbP41155 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LtbP41155 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LtbP41155 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LtbP41155 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LtbP41155 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LtbP41155 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LtbP41155 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LtbP41155 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LtbP41155 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LtbP41155 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LtbP41155 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LtbP41155 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LtbP41155 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LtbP41155 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LtbP41155 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LtbP41155 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LtbP41155 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LtbP41155 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LtbP41155 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms