Protein–RNA interactions for Protein: P40223

Csf3r, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3rP40223 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csf3rP40223 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csf3rP40223 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csf3rP40223 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csf3rP40223 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csf3rP40223 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csf3rP40223 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csf3rP40223 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csf3rP40223 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Csf3rP40223 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csf3rP40223 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csf3rP40223 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csf3rP40223 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csf3rP40223 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csf3rP40223 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Csf3rP40223 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Csf3rP40223 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Csf3rP40223 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Csf3rP40223 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Csf3rP40223 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Csf3rP40223 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Csf3rP40223 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Csf3rP40223 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Csf3rP40223 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Csf3rP40223 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Csf3rP40223 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Csf3rP40223 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Csf3rP40223 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Csf3rP40223 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Csf3rP40223 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Csf3rP40223 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Csf3rP40223 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Csf3rP40223 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Csf3rP40223 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Csf3rP40223 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Csf3rP40223 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Csf3rP40223 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Csf3rP40223 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Csf3rP40223 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Csf3rP40223 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Csf3rP40223 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Csf3rP40223 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Csf3rP40223 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Csf3rP40223 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Csf3rP40223 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Csf3rP40223 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Csf3rP40223 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Csf3rP40223 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Csf3rP40223 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Csf3rP40223 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Csf3rP40223 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Csf3rP40223 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Csf3rP40223 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Csf3rP40223 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Csf3rP40223 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Csf3rP40223 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Csf3rP40223 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Csf3rP40223 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Csf3rP40223 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Csf3rP40223 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Csf3rP40223 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Csf3rP40223 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Csf3rP40223 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Csf3rP40223 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Csf3rP40223 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Csf3rP40223 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Csf3rP40223 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Csf3rP40223 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Csf3rP40223 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Csf3rP40223 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Csf3rP40223 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Csf3rP40223 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Csf3rP40223 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Csf3rP40223 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Csf3rP40223 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Csf3rP40223 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Csf3rP40223 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Csf3rP40223 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Csf3rP40223 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Csf3rP40223 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Csf3rP40223 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Csf3rP40223 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Csf3rP40223 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Csf3rP40223 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Csf3rP40223 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Csf3rP40223 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Csf3rP40223 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Csf3rP40223 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Csf3rP40223 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Csf3rP40223 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Csf3rP40223 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Csf3rP40223 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Csf3rP40223 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Csf3rP40223 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Csf3rP40223 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Csf3rP40223 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Csf3rP40223 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Csf3rP40223 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Csf3rP40223 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Csf3rP40223 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms