Protein–RNA interactions for Protein: P39061

Col18a1, Collagen alpha-1(XVIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col18a1P39061 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Col18a1P39061 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Col18a1P39061 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Col18a1P39061 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Col18a1P39061 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Col18a1P39061 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Col18a1P39061 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Col18a1P39061 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Col18a1P39061 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Col18a1P39061 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Col18a1P39061 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Col18a1P39061 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Col18a1P39061 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Col18a1P39061 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Col18a1P39061 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Col18a1P39061 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Col18a1P39061 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Col18a1P39061 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Col18a1P39061 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Col18a1P39061 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Col18a1P39061 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Col18a1P39061 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Col18a1P39061 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Col18a1P39061 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Col18a1P39061 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Col18a1P39061 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Col18a1P39061 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Col18a1P39061 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Col18a1P39061 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Col18a1P39061 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Col18a1P39061 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Col18a1P39061 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Col18a1P39061 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Col18a1P39061 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Col18a1P39061 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Col18a1P39061 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Col18a1P39061 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Col18a1P39061 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Col18a1P39061 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Col18a1P39061 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Col18a1P39061 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Col18a1P39061 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Col18a1P39061 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Col18a1P39061 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Col18a1P39061 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Col18a1P39061 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Col18a1P39061 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Col18a1P39061 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Col18a1P39061 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Col18a1P39061 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Col18a1P39061 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Col18a1P39061 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Col18a1P39061 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Col18a1P39061 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Col18a1P39061 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Col18a1P39061 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Col18a1P39061 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Col18a1P39061 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Col18a1P39061 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Col18a1P39061 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Col18a1P39061 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Col18a1P39061 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Col18a1P39061 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Col18a1P39061 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Col18a1P39061 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Col18a1P39061 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Col18a1P39061 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Col18a1P39061 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Col18a1P39061 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Col18a1P39061 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Col18a1P39061 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Col18a1P39061 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Col18a1P39061 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Col18a1P39061 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Col18a1P39061 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Col18a1P39061 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Col18a1P39061 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Col18a1P39061 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Col18a1P39061 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Col18a1P39061 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Col18a1P39061 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Col18a1P39061 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Col18a1P39061 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Col18a1P39061 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Col18a1P39061 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Col18a1P39061 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Col18a1P39061 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Col18a1P39061 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Col18a1P39061 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Col18a1P39061 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Col18a1P39061 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Col18a1P39061 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Col18a1P39061 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Col18a1P39061 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Col18a1P39061 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Col18a1P39061 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Col18a1P39061 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Col18a1P39061 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Col18a1P39061 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Col18a1P39061 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms