Protein–RNA interactions for Protein: P35329

Cd22, B-cell receptor CD22, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd22P35329 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd22P35329 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd22P35329 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd22P35329 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd22P35329 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd22P35329 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd22P35329 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd22P35329 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd22P35329 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd22P35329 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd22P35329 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd22P35329 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd22P35329 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd22P35329 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd22P35329 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd22P35329 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd22P35329 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd22P35329 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd22P35329 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd22P35329 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd22P35329 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd22P35329 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd22P35329 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd22P35329 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd22P35329 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd22P35329 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd22P35329 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd22P35329 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd22P35329 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd22P35329 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd22P35329 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd22P35329 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd22P35329 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd22P35329 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd22P35329 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd22P35329 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd22P35329 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd22P35329 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd22P35329 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd22P35329 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd22P35329 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd22P35329 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd22P35329 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd22P35329 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd22P35329 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd22P35329 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd22P35329 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd22P35329 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd22P35329 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd22P35329 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd22P35329 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd22P35329 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd22P35329 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd22P35329 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd22P35329 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd22P35329 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd22P35329 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd22P35329 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd22P35329 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cd22P35329 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cd22P35329 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cd22P35329 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cd22P35329 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cd22P35329 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cd22P35329 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cd22P35329 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cd22P35329 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cd22P35329 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cd22P35329 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cd22P35329 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cd22P35329 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd22P35329 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd22P35329 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd22P35329 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd22P35329 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd22P35329 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd22P35329 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd22P35329 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd22P35329 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd22P35329 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd22P35329 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd22P35329 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd22P35329 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd22P35329 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd22P35329 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd22P35329 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd22P35329 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd22P35329 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd22P35329 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd22P35329 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd22P35329 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd22P35329 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd22P35329 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd22P35329 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd22P35329 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd22P35329 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd22P35329 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd22P35329 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd22P35329 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd22P35329 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms