Protein–RNA interactions for Protein: P35276

Rab3d, Ras-related protein Rab-3D, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3dP35276 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rab3dP35276 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab3dP35276 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms