Protein–RNA interactions for Protein: P35175

Stfa1, Stefin-1, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa1P35175 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stfa1P35175 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stfa1P35175 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms