Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd28P31041 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd28P31041 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd28P31041 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd28P31041 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd28P31041 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd28P31041 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd28P31041 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd28P31041 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd28P31041 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd28P31041 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd28P31041 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd28P31041 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd28P31041 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd28P31041 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd28P31041 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd28P31041 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd28P31041 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd28P31041 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd28P31041 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd28P31041 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd28P31041 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd28P31041 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd28P31041 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd28P31041 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd28P31041 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd28P31041 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd28P31041 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd28P31041 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd28P31041 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd28P31041 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd28P31041 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd28P31041 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd28P31041 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd28P31041 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd28P31041 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd28P31041 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd28P31041 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd28P31041 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd28P31041 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd28P31041 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd28P31041 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd28P31041 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms