Protein–RNA interactions for Protein: P29533

Vcam1, Vascular cell adhesion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcam1P29533 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vcam1P29533 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vcam1P29533 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Vcam1P29533 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vcam1P29533 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vcam1P29533 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vcam1P29533 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vcam1P29533 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vcam1P29533 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vcam1P29533 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vcam1P29533 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vcam1P29533 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vcam1P29533 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vcam1P29533 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vcam1P29533 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vcam1P29533 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vcam1P29533 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vcam1P29533 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Vcam1P29533 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vcam1P29533 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vcam1P29533 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vcam1P29533 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Vcam1P29533 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vcam1P29533 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vcam1P29533 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vcam1P29533 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vcam1P29533 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vcam1P29533 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vcam1P29533 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vcam1P29533 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vcam1P29533 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vcam1P29533 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vcam1P29533 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vcam1P29533 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vcam1P29533 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vcam1P29533 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Vcam1P29533 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vcam1P29533 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vcam1P29533 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vcam1P29533 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vcam1P29533 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vcam1P29533 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vcam1P29533 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vcam1P29533 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vcam1P29533 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vcam1P29533 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vcam1P29533 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vcam1P29533 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vcam1P29533 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vcam1P29533 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vcam1P29533 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vcam1P29533 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vcam1P29533 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vcam1P29533 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Vcam1P29533 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vcam1P29533 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vcam1P29533 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Vcam1P29533 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vcam1P29533 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vcam1P29533 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vcam1P29533 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vcam1P29533 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vcam1P29533 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vcam1P29533 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vcam1P29533 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Vcam1P29533 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vcam1P29533 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vcam1P29533 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vcam1P29533 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vcam1P29533 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vcam1P29533 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Vcam1P29533 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vcam1P29533 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vcam1P29533 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vcam1P29533 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Vcam1P29533 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vcam1P29533 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vcam1P29533 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Vcam1P29533 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vcam1P29533 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vcam1P29533 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vcam1P29533 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vcam1P29533 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vcam1P29533 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vcam1P29533 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vcam1P29533 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vcam1P29533 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vcam1P29533 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vcam1P29533 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vcam1P29533 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vcam1P29533 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vcam1P29533 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vcam1P29533 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vcam1P29533 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vcam1P29533 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vcam1P29533 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Vcam1P29533 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vcam1P29533 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vcam1P29533 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vcam1P29533 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms