Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gjc1P28229 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gjc1P28229 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gjc1P28229 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Gjc1P28229 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gjc1P28229 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gjc1P28229 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Gjc1P28229 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gjc1P28229 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gjc1P28229 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gjc1P28229 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gjc1P28229 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gjc1P28229 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gjc1P28229 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gjc1P28229 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gjc1P28229 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gjc1P28229 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gjc1P28229 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gjc1P28229 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gjc1P28229 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gjc1P28229 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gjc1P28229 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gjc1P28229 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gjc1P28229 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gjc1P28229 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gjc1P28229 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gjc1P28229 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gjc1P28229 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gjc1P28229 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gjc1P28229 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gjc1P28229 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gjc1P28229 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gjc1P28229 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gjc1P28229 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gjc1P28229 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gjc1P28229 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gjc1P28229 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gjc1P28229 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gjc1P28229 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gjc1P28229 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Gjc1P28229 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gjc1P28229 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gjc1P28229 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gjc1P28229 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gjc1P28229 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gjc1P28229 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Gjc1P28229 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gjc1P28229 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Gjc1P28229 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gjc1P28229 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gjc1P28229 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gjc1P28229 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gjc1P28229 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gjc1P28229 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gjc1P28229 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gjc1P28229 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gjc1P28229 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gjc1P28229 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gjc1P28229 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gjc1P28229 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gjc1P28229 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gjc1P28229 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gjc1P28229 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gjc1P28229 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gjc1P28229 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gjc1P28229 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gjc1P28229 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gjc1P28229 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gjc1P28229 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjc1P28229 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjc1P28229 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjc1P28229 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjc1P28229 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjc1P28229 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjc1P28229 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjc1P28229 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjc1P28229 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjc1P28229 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjc1P28229 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjc1P28229 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjc1P28229 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjc1P28229 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjc1P28229 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjc1P28229 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjc1P28229 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjc1P28229 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjc1P28229 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjc1P28229 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjc1P28229 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjc1P28229 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjc1P28229 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjc1P28229 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjc1P28229 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjc1P28229 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gjc1P28229 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gjc1P28229 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gjc1P28229 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gjc1P28229 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gjc1P28229 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gjc1P28229 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms