Protein–RNA interactions for Protein: P23772

Gata3, Trans-acting T-cell-specific transcription factor GATA-3, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata3P23772 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata3P23772 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata3P23772 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gata3P23772 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gata3P23772 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gata3P23772 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gata3P23772 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gata3P23772 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gata3P23772 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gata3P23772 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms