Protein–RNA interactions for Protein: P23708

Nfya, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfyaP23708 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NfyaP23708 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NfyaP23708 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NfyaP23708 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NfyaP23708 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NfyaP23708 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NfyaP23708 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NfyaP23708 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NfyaP23708 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NfyaP23708 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfyaP23708 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfyaP23708 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfyaP23708 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfyaP23708 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfyaP23708 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfyaP23708 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfyaP23708 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NfyaP23708 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfyaP23708 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfyaP23708 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NfyaP23708 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfyaP23708 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfyaP23708 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfyaP23708 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfyaP23708 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfyaP23708 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfyaP23708 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfyaP23708 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfyaP23708 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NfyaP23708 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfyaP23708 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfyaP23708 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfyaP23708 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfyaP23708 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NfyaP23708 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfyaP23708 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfyaP23708 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NfyaP23708 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfyaP23708 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfyaP23708 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfyaP23708 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfyaP23708 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfyaP23708 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfyaP23708 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfyaP23708 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfyaP23708 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfyaP23708 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfyaP23708 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfyaP23708 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfyaP23708 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfyaP23708 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfyaP23708 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfyaP23708 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NfyaP23708 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfyaP23708 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfyaP23708 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfyaP23708 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfyaP23708 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfyaP23708 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfyaP23708 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfyaP23708 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfyaP23708 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfyaP23708 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfyaP23708 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfyaP23708 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfyaP23708 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfyaP23708 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfyaP23708 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfyaP23708 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NfyaP23708 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NfyaP23708 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NfyaP23708 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NfyaP23708 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NfyaP23708 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NfyaP23708 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NfyaP23708 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NfyaP23708 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NfyaP23708 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NfyaP23708 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NfyaP23708 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms