Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gja1P23242 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gja1P23242 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gja1P23242 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gja1P23242 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gja1P23242 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gja1P23242 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gja1P23242 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gja1P23242 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gja1P23242 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gja1P23242 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gja1P23242 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gja1P23242 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gja1P23242 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gja1P23242 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gja1P23242 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gja1P23242 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gja1P23242 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gja1P23242 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gja1P23242 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gja1P23242 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gja1P23242 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gja1P23242 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gja1P23242 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gja1P23242 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja1P23242 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja1P23242 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja1P23242 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja1P23242 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja1P23242 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja1P23242 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja1P23242 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja1P23242 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja1P23242 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja1P23242 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja1P23242 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja1P23242 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja1P23242 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja1P23242 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja1P23242 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja1P23242 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja1P23242 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gja1P23242 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gja1P23242 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gja1P23242 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gja1P23242 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gja1P23242 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gja1P23242 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gja1P23242 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gja1P23242 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gja1P23242 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gja1P23242 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gja1P23242 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gja1P23242 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gja1P23242 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gja1P23242 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gja1P23242 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gja1P23242 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gja1P23242 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gja1P23242 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gja1P23242 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gja1P23242 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gja1P23242 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gja1P23242 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gja1P23242 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gja1P23242 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gja1P23242 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gja1P23242 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gja1P23242 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gja1P23242 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gja1P23242 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gja1P23242 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gja1P23242 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gja1P23242 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gja1P23242 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gja1P23242 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gja1P23242 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gja1P23242 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gja1P23242 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gja1P23242 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gja1P23242 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gja1P23242 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gja1P23242 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gja1P23242 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gja1P23242 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gja1P23242 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gja1P23242 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Gja1P23242 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gja1P23242 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gja1P23242 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Gja1P23242 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gja1P23242 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gja1P23242 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gja1P23242 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gja1P23242 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gja1P23242 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gja1P23242 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gja1P23242 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gja1P23242 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gja1P23242 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms