Protein–RNA interactions for Protein: P22387

Edn1, Endothelin-1, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn1P22387 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Edn1P22387 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Edn1P22387 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Edn1P22387 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Edn1P22387 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Edn1P22387 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Edn1P22387 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Edn1P22387 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Edn1P22387 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Edn1P22387 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Edn1P22387 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Edn1P22387 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Edn1P22387 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Edn1P22387 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Edn1P22387 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Edn1P22387 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Edn1P22387 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Edn1P22387 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Edn1P22387 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Edn1P22387 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Edn1P22387 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Edn1P22387 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Edn1P22387 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Edn1P22387 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Edn1P22387 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Edn1P22387 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Edn1P22387 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Edn1P22387 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Edn1P22387 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Edn1P22387 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Edn1P22387 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Edn1P22387 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Edn1P22387 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Edn1P22387 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Edn1P22387 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Edn1P22387 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Edn1P22387 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Edn1P22387 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Edn1P22387 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Edn1P22387 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Edn1P22387 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Edn1P22387 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Edn1P22387 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Edn1P22387 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Edn1P22387 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Edn1P22387 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Edn1P22387 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Edn1P22387 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Edn1P22387 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Edn1P22387 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Edn1P22387 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Edn1P22387 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Edn1P22387 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Edn1P22387 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Edn1P22387 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Edn1P22387 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Edn1P22387 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Edn1P22387 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Edn1P22387 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Edn1P22387 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Edn1P22387 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Edn1P22387 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Edn1P22387 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Edn1P22387 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Edn1P22387 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Edn1P22387 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Edn1P22387 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Edn1P22387 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Edn1P22387 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Edn1P22387 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Edn1P22387 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Edn1P22387 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Edn1P22387 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Edn1P22387 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Edn1P22387 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Edn1P22387 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Edn1P22387 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Edn1P22387 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Edn1P22387 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Edn1P22387 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Edn1P22387 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Edn1P22387 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Edn1P22387 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Edn1P22387 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Edn1P22387 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Edn1P22387 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Edn1P22387 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Edn1P22387 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Edn1P22387 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Edn1P22387 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Edn1P22387 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Edn1P22387 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Edn1P22387 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Edn1P22387 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Edn1P22387 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Edn1P22387 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Edn1P22387 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Edn1P22387 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Edn1P22387 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Edn1P22387 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms