Protein–RNA interactions for Protein: P22339

Gadd45b, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 beta, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gadd45bP22339 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gadd45bP22339 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gadd45bP22339 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gadd45bP22339 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gadd45bP22339 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gadd45bP22339 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gadd45bP22339 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gadd45bP22339 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gadd45bP22339 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gadd45bP22339 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gadd45bP22339 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gadd45bP22339 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gadd45bP22339 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gadd45bP22339 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gadd45bP22339 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gadd45bP22339 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gadd45bP22339 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gadd45bP22339 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gadd45bP22339 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gadd45bP22339 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gadd45bP22339 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gadd45bP22339 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gadd45bP22339 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gadd45bP22339 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gadd45bP22339 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gadd45bP22339 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gadd45bP22339 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gadd45bP22339 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gadd45bP22339 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gadd45bP22339 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gadd45bP22339 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gadd45bP22339 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gadd45bP22339 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gadd45bP22339 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gadd45bP22339 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gadd45bP22339 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gadd45bP22339 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gadd45bP22339 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gadd45bP22339 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gadd45bP22339 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gadd45bP22339 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gadd45bP22339 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gadd45bP22339 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gadd45bP22339 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gadd45bP22339 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gadd45bP22339 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gadd45bP22339 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gadd45bP22339 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gadd45bP22339 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gadd45bP22339 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gadd45bP22339 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gadd45bP22339 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gadd45bP22339 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gadd45bP22339 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gadd45bP22339 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gadd45bP22339 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gadd45bP22339 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gadd45bP22339 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gadd45bP22339 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gadd45bP22339 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gadd45bP22339 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gadd45bP22339 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gadd45bP22339 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gadd45bP22339 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gadd45bP22339 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gadd45bP22339 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gadd45bP22339 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gadd45bP22339 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gadd45bP22339 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gadd45bP22339 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gadd45bP22339 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gadd45bP22339 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gadd45bP22339 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gadd45bP22339 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gadd45bP22339 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gadd45bP22339 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gadd45bP22339 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gadd45bP22339 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gadd45bP22339 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gadd45bP22339 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gadd45bP22339 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gadd45bP22339 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gadd45bP22339 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gadd45bP22339 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gadd45bP22339 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gadd45bP22339 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gadd45bP22339 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gadd45bP22339 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gadd45bP22339 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gadd45bP22339 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gadd45bP22339 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gadd45bP22339 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gadd45bP22339 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gadd45bP22339 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gadd45bP22339 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gadd45bP22339 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gadd45bP22339 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gadd45bP22339 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gadd45bP22339 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gadd45bP22339 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms