Protein–RNA interactions for Protein: P20826

Kitlg, Kit ligand, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KitlgP20826 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KitlgP20826 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KitlgP20826 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KitlgP20826 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KitlgP20826 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KitlgP20826 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KitlgP20826 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KitlgP20826 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KitlgP20826 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KitlgP20826 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KitlgP20826 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KitlgP20826 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KitlgP20826 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KitlgP20826 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KitlgP20826 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KitlgP20826 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KitlgP20826 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KitlgP20826 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KitlgP20826 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KitlgP20826 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KitlgP20826 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KitlgP20826 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KitlgP20826 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KitlgP20826 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KitlgP20826 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KitlgP20826 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KitlgP20826 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KitlgP20826 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KitlgP20826 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KitlgP20826 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KitlgP20826 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KitlgP20826 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KitlgP20826 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KitlgP20826 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KitlgP20826 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KitlgP20826 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KitlgP20826 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KitlgP20826 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KitlgP20826 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KitlgP20826 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KitlgP20826 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KitlgP20826 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KitlgP20826 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KitlgP20826 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KitlgP20826 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KitlgP20826 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KitlgP20826 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
KitlgP20826 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KitlgP20826 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KitlgP20826 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KitlgP20826 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KitlgP20826 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KitlgP20826 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KitlgP20826 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KitlgP20826 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KitlgP20826 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KitlgP20826 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KitlgP20826 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KitlgP20826 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KitlgP20826 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KitlgP20826 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KitlgP20826 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KitlgP20826 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KitlgP20826 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KitlgP20826 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KitlgP20826 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KitlgP20826 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KitlgP20826 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KitlgP20826 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KitlgP20826 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KitlgP20826 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KitlgP20826 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KitlgP20826 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KitlgP20826 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KitlgP20826 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KitlgP20826 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KitlgP20826 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KitlgP20826 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KitlgP20826 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KitlgP20826 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KitlgP20826 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KitlgP20826 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KitlgP20826 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KitlgP20826 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KitlgP20826 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KitlgP20826 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KitlgP20826 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KitlgP20826 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KitlgP20826 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KitlgP20826 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KitlgP20826 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KitlgP20826 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KitlgP20826 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KitlgP20826 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KitlgP20826 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KitlgP20826 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KitlgP20826 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KitlgP20826 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KitlgP20826 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KitlgP20826 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms