Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NefhP19246 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NefhP19246 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NefhP19246 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NefhP19246 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NefhP19246 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NefhP19246 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NefhP19246 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NefhP19246 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NefhP19246 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NefhP19246 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NefhP19246 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NefhP19246 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NefhP19246 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NefhP19246 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NefhP19246 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NefhP19246 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NefhP19246 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NefhP19246 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NefhP19246 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NefhP19246 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NefhP19246 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NefhP19246 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NefhP19246 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NefhP19246 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NefhP19246 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NefhP19246 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NefhP19246 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NefhP19246 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NefhP19246 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NefhP19246 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NefhP19246 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NefhP19246 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NefhP19246 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NefhP19246 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NefhP19246 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NefhP19246 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NefhP19246 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NefhP19246 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NefhP19246 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NefhP19246 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NefhP19246 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NefhP19246 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NefhP19246 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NefhP19246 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NefhP19246 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NefhP19246 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NefhP19246 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NefhP19246 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NefhP19246 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NefhP19246 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NefhP19246 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NefhP19246 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NefhP19246 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NefhP19246 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NefhP19246 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NefhP19246 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NefhP19246 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NefhP19246 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NefhP19246 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NefhP19246 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NefhP19246 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NefhP19246 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NefhP19246 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NefhP19246 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NefhP19246 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NefhP19246 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NefhP19246 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NefhP19246 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NefhP19246 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NefhP19246 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NefhP19246 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NefhP19246 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NefhP19246 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NefhP19246 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NefhP19246 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NefhP19246 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NefhP19246 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NefhP19246 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NefhP19246 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NefhP19246 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NefhP19246 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NefhP19246 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NefhP19246 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NefhP19246 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NefhP19246 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NefhP19246 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NefhP19246 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NefhP19246 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NefhP19246 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NefhP19246 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NefhP19246 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NefhP19246 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NefhP19246 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NefhP19246 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NefhP19246 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NefhP19246 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NefhP19246 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NefhP19246 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NefhP19246 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms