Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rps6ka3P18654 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rps6ka3P18654 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rps6ka3P18654 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps6ka3P18654 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps6ka3P18654 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps6ka3P18654 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps6ka3P18654 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps6ka3P18654 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps6ka3P18654 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps6ka3P18654 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps6ka3P18654 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps6ka3P18654 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps6ka3P18654 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps6ka3P18654 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps6ka3P18654 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Rps6ka3P18654 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rps6ka3P18654 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rps6ka3P18654 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rps6ka3P18654 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rps6ka3P18654 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rps6ka3P18654 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rps6ka3P18654 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rps6ka3P18654 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps6ka3P18654 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms