Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rps6ka1P18653 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rps6ka1P18653 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rps6ka1P18653 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rps6ka1P18653 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rps6ka1P18653 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rps6ka1P18653 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rps6ka1P18653 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rps6ka1P18653 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rps6ka1P18653 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rps6ka1P18653 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rps6ka1P18653 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rps6ka1P18653 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rps6ka1P18653 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rps6ka1P18653 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rps6ka1P18653 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rps6ka1P18653 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rps6ka1P18653 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rps6ka1P18653 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rps6ka1P18653 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rps6ka1P18653 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rps6ka1P18653 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rps6ka1P18653 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rps6ka1P18653 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rps6ka1P18653 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rps6ka1P18653 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rps6ka1P18653 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rps6ka1P18653 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rps6ka1P18653 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rps6ka1P18653 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rps6ka1P18653 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rps6ka1P18653 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rps6ka1P18653 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rps6ka1P18653 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rps6ka1P18653 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rps6ka1P18653 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rps6ka1P18653 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rps6ka1P18653 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rps6ka1P18653 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rps6ka1P18653 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rps6ka1P18653 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Rps6ka1P18653 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rps6ka1P18653 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rps6ka1P18653 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rps6ka1P18653 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rps6ka1P18653 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rps6ka1P18653 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rps6ka1P18653 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rps6ka1P18653 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rps6ka1P18653 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms